Постановлением Правительства Российской Федерации Минэкономразвития России наделено полномочиями по координации и нормативно-правовому регулированию в сфере приграничного сотрудничества.
Федеральным законом «Об основах приграничного сотрудничества» определены основные принципы, задачи и направления приграничного сотрудничества, а также полномочия субъектов приграничного сотрудничества, которыми являются Российская Федерация, приграничные субъекты Федерации и муниципальные образования приграничных субъектов Федерации.
В их числе разработка, реализация и обеспечение проведения единой государственной политики в сфере приграничного сотрудничества, определение приоритетных направлений приграничного сотрудничества; координация осуществляемого органами государственной власти субъектов Федерации приграничного сотрудничества; представление интересов Российской Федерации в сфере приграничного сотрудничества в отношениях с сопредельными государствами и международными организациями; разработка, реализация и оценка эффективности международных программ приграничного сотрудничества и проектов таких программ.
Соответствующие изменения внесены в Положение о Министерстве экономического развития Российской Федерации.